Нуклеотидна послідовність
Послідовність нуклеотидів – це різновид генетичного рівноваги і балансу розташування амінокислот в структурі ДНК, своєрідний порядок розміщення залишків ефіру у складі нуклеїнових кислот.
Він визначається за допомогою традиційного методу секвенування відібраного для аналізу біологічного матеріалу.
За рекомендацією всесвітньої організації IUPAC послідовність нуклеотидів записується шляхом використання наступних літер латинського алфавіту з подальшою розшифровкою:
Т – тимін;
А – аденін;
G – гуанін;
З – цитозин;
R – GA аденін в комплексі з гуаніном і підставами пурину;
Y – TC пиримидиновые з’єднання;
K – GT нуклеотиди, що містять кетогруппу;
M – AC входять в аміногрупу;
S – GC потужні, що відрізняються трьома водневими сполуками;
W – AT нестійкі, які утворюють лише по дві водневі зв’язки.
Послідовність нуклеотидів може змінюватися, а позначення латинськими літерами необхідні в тих випадках, коли порядок розташування ефірних сполук невідомий, є несуттєвим або вже є результати первинних досліджень.
Найбільшу кількість варіантів і комбінацій нуклеозидфосфатов властиво для ДНК. Для запису ефірних сполук РНК досить символів A, С, G, U. Останнім літерне позначення є речовиною уридин, яке зустрічається тільки в РНК. Послідовність символічних позначень завжди записується без пропусків.